Mikroflora jelit - nasz wróg czy sojusznik?

Ludzki organizm zawiera 10 razy więcej komórek drobnoustrojów niż własnych, a liczba genów tych drobnoustrojów stukrotnie przewyższa liczbę genów człowieka. Poznano już zapis genetyczny około 10 000 szczepów drobnoustrojów, mimo to wiedza dotycząca informacji genetycznej zawartej w komórkach mikroorganizmów jest nadal mocno ograniczona, co związane jest głównie z faktem, że na sztucznych podłożach potrafimy wyhodować tylko 20–60% gatunków bakterii bytujących w organizmach żywych.  Rozwój metagenomiki, strategii pozwalających na sekwencjonowanie materiału genetycznego bezpośrednio ze środowisk naturalnych pozwala na przezwyciężenie tych ograniczeń.  Aktualnie realizowanych jest kilka projektów metagenomowych dotyczących mikroorganizmów kolonizujących organizm człowieka. Te ogólnoświatowe inicjatywy mają na celu poznanie genomów mikroorganizmów, występujących w ciele człowieka i kształtujących jego metabolizm, a także ich wpływu na procesy fizjologiczne oraz predyspozycje do zapadalności na różne choroby. Analizie poddawanych jest pięć nisz ekologicznych organizmu ludzkiego:– skóra, układ pokarmowy, jama ustna i jelito, układ moczowopłciowy oraz układ oddechowy . Najwięcej uwagi w badaniach nad mikrobiomem człowieka poświęca się analizie różnorodności mikroorganizmów obecnych w przewodzie pokarmowym , a w szczególności w jelitach (1g kału człowieka zawiera 1012 komórek bakterii). Mikroflora jelit jest niezbędna do utrzymania prawidłowego stanu zdrowia człowieka, a jej zmiany doprowadzają często do wystąpienia chorób jelitowych (przewlekłe stany zapalne czy choroby nowotworowe). Zaburzenia mikroflory skutkują też podwyższeniem ryzyka wystąpienia schorzeń ogólnoustrojowych (cukrzyca czy otyłość).